2001年将生理学、药理学、病理生理学教学实验室合并，组建了医学机能学实验室。2002年机能学实验室被评为省级合格实验室。目前共有8间本科教学实验室、1间本科创新实验室和1间膜片钳电生理实验室。现有管理和实验技术人员11人，其中专职实验技术人员10人。

  2022年实验室仪器设备得到了全面更新，构建了4间人体机能实验室和4间信息化集成动物实验室，配备了小动物呼吸机、人体及动物集成化信号采集系统、缺氧仪、离心机、分光光度计、电压钳和膜片钳等实验设备，设备总值约800万元。实验室实现信息化、网络化、线上线下多手段、多层次、多元化的实验教学和管理，并利用三维仿真、多媒体、人机交互等技术，与企业合作自主研发医学机能虚拟仿真实验项目，丰富了实验教学内容。在保留经典机能动物实操实验的基础上，逐渐增加富有挑战性的整合性、设计性及人体机能实验，拓展了学生学习的深度与广度，不仅培养了学生的实验技能、动手能力和创新意识，还提高了学生综合分析问题和解决问题的能力。实验室主编出版了医学机能实验双语教材，不仅方便了国际留学生教学，同时使教师和学生的专业英语水平得到了提升。