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兰州大学基础医学院病原生物学研究所的前身是1953年组建的兰州大学医学院寄生虫学教学组。由申允中，赛书元，曹和洵组成，申允中任组长。1954年兰州医学院独立建院，1957年刘德山同志调来我院正式成立寄生虫学教研室，刘德山任组长，曹和洵任秘书。1992年被甘肃省确定为省教委重点专业。2003年6月，随着免疫学硕士点授予权被批准。免疫学教研室的成立，将寄生虫学教研室和微生物教研室合并成立病原生物学教研室，并将包虫研究室归入病原生物学教研室。2004年11月兰州医学院并入兰州大学，2005年7月成立病原生物学研究所，每年承担临床医学、预防医学、药学、护理学和医学检验的本科及专科的教学工作。現为甘肃省重点学科，继续教育基地之一，拥有4间可供教学使用的实验室和4间可供本教研室科研专用的实验室。
病原生物学专业1979年开始招收硕士研究生。1981年11月，病原生物学专业获得了国务院学位办首批批准的具有硕士授予权单位。至今已培养硕士研究生50余人，有30余人曾在或继续在国内外攻读博士和博士后，至今有8人在国外研究所或大学工作。
自教研室成立以来，本教研室教师多人获得学校优秀教师，并多次在学校组织的讲课比赛中获奖，先后有6人出国学习或进修，不断提高业务水平，发表教学论文20余篇，寄生虫学教学改革及系列教材(编写的人体寄生虫学教程内部出版)曾获甘肃省教学成果一等奖（1997年）。编写的《棘球绦虫和包虫病》获1997年甘肃省科技进步二等奖，编写的《棘球蚴病的临床与基础研究》获2002年甘肃省教育厅科技进步二等奖，曾参与编写《人体寄生虫学》专科全国统一教材1部(2版)；主编或参编的本学科教学参考书《现代应用寄生虫学》、《包虫病学》、《医学分子生物学》、《现代应用寄生虫学》、《肝胆寄生虫病学》、《包虫病学》、《中华医学临床研究》、包虫病分册》、《消化病现代治疗》等。
目前参加美国NIH(national institute health)项目“中国西部的包虫病”1项,我室是该项目合作单位之一。英国 wellcome trust合作项目“包虫的中药治疗”2项；另有省科委研究项目2項,省教育厅项目3项。甘肃省甘肃省优秀专家1人（1997），甘肃省跨世纪学科带头人1人（1996），同时进入“333”人才项目第一、二层次1人（2000年）。
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